鱼类水霉病主要发生于因寄生虫寄生，拥挤、移动或其他不良环境因素的影响，造成体表组织受伤，被水体中的水霉菌游离孢子附着，在坏死组织上开始发芽形成菌丝，菌丝除寄生于坏死组织外，尚可漫延侵入附近的正常组织，分泌消化酵素分解周围组织，更而贯穿真皮深入肌肉，使皮肤与肌肉坏死崩解。表层的菌丝则向外延伸，形成如棉絮状的覆盖物，并于末端形成孢子囊，放出游离孢子到水中，经由水而传播各处。
（感染水霉的鱼）水霉是条件致病性真菌，鱼类感染水霉受以下条件影响：
（1）鱼体受伤是水霉病发生的必备条件，水霉菌在淡水中虽然广泛存在，水中存在有水霉菌，并不意味着一定要发生水霉病。倪达书经过反复试验研究，确认水霉菌本质上属于腐生性，没有受伤的健康鱼是不会被感染，它只会在已经死亡或受伤的鱼体或卵粒组织上生长繁殖。
（2）温度是影响水霉病的发生的关键因素。不同温度下（5-26℃）都能生长，水霉病多发于晚冬和早春时节，当水温低于20℃时易发生此病，其繁殖适温为15-18℃，28℃时受到抑制。
（3）水体pH值影响水霉病的发生。水体pH=7.2对水霉生长最佳，水霉孢子繁殖旺盛；水体pH=6.0-8.0时候，鱼卵一般也可感染水霉，但是游动孢子的形成能力较弱；pH=4.5-5.5时水霉的生长完全受到抑制。
（鱼体表损伤是感染水霉病最大诱因）（4）水体盐度影响水霉病发生。水霉菌对盐度的反应敏感。
（5）水质影响水霉病发生。进入冬季以后，以阴雨天气为主，光照弱，多数池塘水偏瘦，不利于保温，且水体本身产氧能力弱，水分层严重，水体长期处于缺氧状态，鱼体质差，给水霉菌感染鱼体创造有利条件。有机质含量高的水体也容易发生水霉病。
（6）随着气温和水温不断下降，鱼类吃料速度逐渐变缓，且消化利用率也逐渐降低，因此造成养殖中后期鱼类营养不良或消化受阻，最终导致鱼类体质虚弱、抗应激能力降低，长期处于亚健康状态，极易感染水霉菌引发水霉病。
水霉病的治疗途径主要是水质水体泼洒药物，常用药物包括抗真菌药物水杨酸、硫醚沙星、二硫氰基甲烷、亚甲基蓝、五倍子、苦参、地肤子、小苏打食盐合剂等，临床治疗时还要配合消毒剂使用，可选择福尔马林、冰醋酸、高锰酸钾、苯扎溴铵、戊二醛、聚维酮碘等。
鱼类水霉病治疗方案
第一步：先使用高锰酸钾进行水体消毒杀菌。
（高锰酸钾）高锰酸钾为强氧化剂。其水溶液与有机物接触，能释放出新生态氧，迅速使有机物氧化，使酶蛋白和原浆蛋白中的活性基团如巯基(SH)氧化变为二硫链（-S-S)而失活，从而呈杀菌作用。其抗菌效力在酸性环境中增强，但极易为有机物所减弱。此外，还因其强氧化作用，可使生物碱、氯化物、磷、草酸盐及蛇毒等被破坏而丧失(毒)活性。具有解毒、除臭作用。本品与蛋白质结合形成复合物而对伤口有收敛作用。本品可用作消毒、防腐，防治细菌性疾病。此外，还可杀灭原虫类、单殖吸虫类和红头鳋等寄生虫。
高锰酸钾治疗鱼类水霉病剂量：-g/亩*米水体。
第二步：水体泼洒高锰酸钾5小时后，再水体泼洒水杨酸。
（水杨酸）水杨酸又名柳酸，化学名称是邻羟基苯甲酸，是含有石碳酸环的环形结构物。存在于自然界的柳树皮、白珠树叶及甜桦树中。在医药方面，水杨酸具有抗真菌、止痒及溶解角质作用。在鱼体表感染真菌时，水杨酸可软化角质层，角质层脱落时，也将菌丝同时脱落。水杨酸防治水霉病的原理是：在鱼体表感染水霉菌时，水杨酸可软化病变部位的角质层，导致角质层脱落，也将菌丝同时脱落。水杨酸不能杀死真菌，也不能直接抑制真菌繁殖。因此水杨酸用于水霉病的预防效果不明显，水杨酸仅在发生水霉病，看到菌丝（白毛）时才有效果。水杨酸主要协助其他抗真菌药物的穿透，水杨酸类药物应复配抗真菌药物使用效果更理想。
此外，水杨酸还具有抗炎消炎的作用，它主要是通过对炎症因子的抑制，而达到消炎效果。具体来说是抑制花生四烯酸的代谢，减少类似前列腺素、血栓素、白三烯这类炎症因子的释放。从而减少血管的通透性，减少水肿，减少免疫细胞的活化，减少疼痛，和祛热。同时还可以通过NF-κb（核因子活化B细胞κ轻链增强子）通路降低单核细胞和巨噬细胞的活性，从而达到减轻炎症的效果。
水杨酸治疗鱼类水霉病剂量：-g/亩*米水体。
第三步：水体泼洒水杨酸后第二天，全池泼洒五倍子煎剂，每天1次，连用2-3天。
（五倍子）五倍子含五倍子鞣质(Gallotannin)、没食子酸、单宁酸、癸酸、月桂酸、肉豆蔻酸、棕榈酸、硬脂酸、油酸、亚油酸、亚麻酸、树脂、腊质、淀粉等。抗真菌药理作用如下：
（1）收敛、止血作用。五倍子鞣质能与蛋白质结合生成不溶于水的大分子沉淀物，皮肤黏膜、溃疡接触鞣质后，其组织蛋白即被凝固，造成一层被膜而呈收敛作用，同时小血管也被压迫收缩，血液凝结而具止血功效。以五倍子为主的复方五倍子液对胃黏膜出血能显著减少出血量，缩短出血时间。腺细胞的蛋白被凝固引起分泌抑制，产生黏膜干燥，神经末梢蛋白质的沉淀，可呈微弱局部麻醉现象。
（2）杀菌、抗真菌、抗病毒作用。五倍子煎剂对绿脓杆菌、痢疾杆菌、变形杆菌、大肠杆菌、产气杆菌、伤寒杆菌等革兰阴性菌和金黄色葡萄球菌、白色葡萄球菌、乙型链球菌、肺炎双球菌、白喉杆菌、炭疽杆菌等革兰阳性菌均有不同程度的抑制作用。五倍子在体外对耐万古霉素肠球菌也有抗菌活性，对某些致病性真菌也有较强的抑制作用。对接种于鸡胚的流感甲型PR株病毒有抑制作用，除去鞣质后的五倍子液仍有抗菌作用。
五倍子治疗鱼类水霉病剂量：-g/亩*米水体，煎剂。