本病的治疗在调脾胃、复运化基础上还需重视病因治疗以及饮食调理。以扶助中焦脾胃，增加水谷精微摄纳为原则，侧重补虚，兼顾恢复脏腑功能。
（1）药、食结合，增其化源：脾为后天之本，为气血生化之源。中焦受气取汁，变化而赤，是谓血也。可见影响本病的关键在于中焦脾胃功能是否正常，水谷精微是否充足，两者缺一，则发为萎黄病，久之影响他脏，迁延缠绵，可进展为虚劳。倘若治疗中仅执一端，如一味补充水谷精微，可致脾胃虚不受补，更益其虚，甚至变证迭出，脏腑功能紊乱。倘若单纯健脾助运，而不增加水谷精微的补充，则化生乏源，仍不得效。鼓励患者进食瘦肉、猪肝、猪血、蛋黄、豆腐、大枣、菠菜、黑豆、扁豆等。
（2）重调脾胃，促其运化：脾胃为气血生化之源，饮食依靠脾胃的腐熟运化成为水谷精微，然后化生成血液。故促进饮食，增其化源尤为重要。药用枳实、鸡内金、白术、焦山楂、太子参、蒲公英、乌梅、木瓜、莪术等以健脾理气、消食导滞，用于脾虚气滞所致的食欲缺乏、食后胀满、倦怠乏力、脘腹满闷等症。可促进缺铁性贫血患者对铁的吸收利用，同时可以有效减轻服用铁剂所造成的不良反应
（3）重视病因，审因证治：本病病因多端，病机繁复，但最终均可导致脾胃运化失司，故脾胃虚弱，气血两虚为其基本病因病机，健脾益胃、益气生血为其根本治则。临证必须细审病因，四诊合参，因寒者温阳健脾；因热者，实热清热泻火，虚热滋阴清热，切忌苦寒伤胃；因湿者健脾渗湿；因气虚者补中益气；因气郁者疏肝理气；因血虚者养血生血；因血瘀者活血化瘀；因邪毒者扶正祛邪。
（4）辨证与辨病相结合：临证应需辨证与辨病相结合，辨病必需以辨证为核心。慢性胃炎者多伴胃胀、纳呆等症，宜加焦三仙、鸡内金等促进运化；胃肠溃疡多伴烧心、泛酸等症，宜重用海螵蛸、瓦楞子抑酸，川楝子止痛；癌肿者宜加用半枝莲、黄药子等清热解毒抗癌之品；癥瘕（肝脾大）者宜加龟甲、鳖甲、牡蛎等软坚散结；溃疡黑便者，加用蒲黄炭、白及粉、阿胶珠、汉三七，以收敛、凉血、止血而不留瘀，且阿胶珠、藕粉冲调后呈黏稠膏状，服用后可敷布于胃肠黏膜，既有利于药物缓慢排空，更好的发挥疗效，又可保护黏膜创面，利于止血。临证应注意所加辨病治疗药物必须符合辨证之病机，切忌以西医药理替代中医辨证论治，一味叠加堆砌。
（5）整体观念，提纲挈领：临床需要注意缺铁引起的不仅仅是面黄、乏力（贫血）一症，很多患者表现为失眠健忘、注意力不集中、急躁易怒等心脾不足或心肝火旺症状，均源于水谷精微不足，神失所养。临床只要抓住本病脾胃运化不足的基本病机，脏腑相连，气血不荣，即可抓住主要矛盾，虽并非治疗其症状，却可收围魏救赵、移花接木之功。